La galería Juana de Aizpuru se fundó en Sevilla en 1970, en la calle Canalejas número 10 aunque, posteriormente, en el año 1986, se trasladó la sede a la calle Zaragoza 26, instalándose en una antigua casa sevillana de 3 pisos.
La sede de Madrid se abrió en 1983, en la calle Barquillo 44, que es donde permanece desde entonces.
En el año 2004 se cerró el espacio sevillano.